En 2027, un an après la fin de la IVeme Guerre Mondiale, le monde est révolutionné par l'émergence de la cybernétique et des technologies informatiques qui permettent la naissance de nouvelles formes criminelles totalement inédites. Les films de Ghost in the Shell : Arise racontent toute l'histoire de la formation de la célèbre section 9 et révèlent nombre de secrets sur le passé de ses membres.